Черная ножка — грозное грибное заболевание рассады, возбудители которого всегда присутствуют в почве и при благо приятных условиях поражают ослабленные растения, С участка грунт для рассады нужно набрать с осени, сложить в мешок или ящик и выставить на мороз, а перед посевом 40-50 минут пропарить в духовке, предварительно полив кипятком. Покупной грунт для рассады также обязательно нужно пропарить.
Возбудитель этого заболевания любит кислую среду, поэтому нелишним будет провести известкование субстрата. Для этого можно использовать доломитовую муку или золу (на 1 ведро грунта 0,5 л золы). Земля, в которой выращивается рассада, должна быть рыхлой, а емкость иметь дренажные отверстия. Поливать сеянцы следует очень умеренно, так как появление черной ножки провоцирует излишняя влага. Если появились только первые признаки заболевания, а сеянцы уже достаточно крепкие, растения еще можно спасти, на некоторое время прекратив полив и подсыпав к стебелькам сухой песок, В дальнейшем рассаду можно поливать слабым раствором марганцовки. Как лечение заболевания и профилактическая мера хороший результат дает oпрыскивание сеянцев  Фитоспорином. Фитолавином, Бактофитом.